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Nocardia farcinica Genome Project Page
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RhizoBase(Genome database for Rhizobia with annotation)
Mycoplasma penetrans Genome
MBGD(Microbial Genome Database for Comparative Analysis)
BSORF(Bacillus subtilis Genome Database)
PEC(Profiling of E. coli Chromosome)
Extremo Base(Genome Sequences Analyzed by JAMSTEC)
Schizosaccharomyces pombe Postgenome Database
CyanoBase(Genome database for Cyanobacteria)
ARCHAIC(Archaebacterial Information Collection)
TEC database
GenEpid-J
KEGG GENOME
A web-based comparative genome browser between human and other vertebrate genomes (G-compass)
GIB(Genome Information Broker)
遺伝子・転写産物
Evola(Evolutionary annotation database)
GGDB(GlycoGene Database)
H-InvDB(H-Invitational Database)
RefSeq(Reference Sequence)
NEDO database(New Energy and Industrial Technology Development Organization Database)
H-DBAS(Human-transcriptome DataBase for Alternative Splicing)
FLJ Human cDNA Database
Gene(Entrez Gene Human)
FANTOM4(Functional Annotation of the Mammalian Genome)
DDPC
HGPD(Human Gene and Protein Database)
KEGG GENES
ED-Genes
snoDB
VISDB: Viral Integration Site DataBase
CDT-DB
FANTOM3(Functional Annotation of Mouse 3)
Gene(Entrez Gene Mouse)
ROUGE(A Database of Rodent Unidentified Gene-Encoded Large Proteins Analyzed by Kazusa Mouse cDNA Project)
EGTC(Database for the Exchangeable Gene Trap Clones)
XDB
JDD(Japan Drosophila Database)
CiAID
FANTOM5
Bombyx Trap DataBase
Malaria Full-Length cDNA Database (Plasmodium falciparum)
MiFuP Safety
GenoBase ver.6[アーカイブデータ]
Hepatitis Virus Database (Analysis results of hepatitis virus gene, lineage)
MicrobeDB.jp
Dicty_cDB(Dictyostelium cDNA Database)
DoBISCUIT
RAP-DB(Rice Annotation Project DataBase)
シロイヌナズナ転写因子クローン(TF clone)データベース
FioreDB
ChIP-Atlas
KOME(Knowledge-Oriented Molecular Biological Encyclopedia)
Q-TARO(QTL Annotation Rice Online database)
KATANA
Database for Genetic Engineering of Microalgae (微細藻類遺伝子工学データベース)
TodoFirGene
TFGD: Tomato Functional Genomics Database
TADB 2.0
PHYSCObase
RAPID
Transposon tag line Database Search
TAB project(Transcription Analysis of BY-2)
RPG(Ribosomal Protein Gene Database)
KEGG OGENES
non-B DB
Codon Usage Database
多型
GWAS(Genome Wide Association Study Database)
KMDB/MutationView (Keio Mutation Databases)
PharmGKB(Pharmacogenomics Knowledge Base)
VarySysDB
統合がんゲノムデータベース
Comparative Genomic Hybridization Database
MCG CNV Database
RAvariome(Rheumatoid Arthritis variome)
VaDE
Polymorphism of Microsatellite Markers
TOHO rSNP DB
TOHO rSNP DB2
JSNP(Japanese Single Nucleotide Polymorphisms)
dbQSNP(SNPs in the transcriptional promoter regions in human)
DPV
dbDNV: Duplicated-gene Nucleotide Variants
OGRDB: Open Germline Receptor Database
MMDBJ(Mouse Microsatellite Data Base of Japan)
VegMarks(a DNA marker database for vegitables)
Soybean Marker Database
KaTomicsDB(Tomato Marker)
KaTomicsDB(Tomato Functional SNP DataBase)
機能RNA
snoDB
tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)
fRNAdb(Functional RNA Database)
snoOPY(snoRNA Orthological Gene Database)
RNAapt3D
遺伝子発現・転写制御
転写モチーフ
DBTGR(Database of Tunicate Gene Regulation)
Riken Transcription Factor Database
FlyFactorSurvey
ATTED-II (Gene expression database of Arabidopsis coexpression)
PPDB(PlantPromoterDB)
PLACE(A DB of Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements)
RARTF
DBTBS(A database of transcriptional regulation in Bacillus subtilis containing upstream intergenic conservation information)
DBSCR
S. cerevisiae OriDB
S. pombe OriDB
DBTSS(Database of Transcriptional Start Sites)
JASPAR
ASTRA(Alternative Splicing and Transcription Archives)
EST
MAboya ( the ascidian, Halocynthia roretzi ) Gene Expression patterns and Sequence Tags
BodyMap-Xs: anatomical and taxonomical breakdown of animal EST
SilkBase (EST analysis of silkworm gene expression)
KAIKOcDNA
Full-Anopheles
ZFIN:The Zebrafish Model Organism Database
FlyBase: A Database of Drosophila Genes & Genomes
WormBase
NEXTDB
Pt_spiderBASE
MiBASE (Micro-Tom Database)
PHYSCObase
RGP(The Rice Genome Research Program)
KaFTom
Poplar Full-Length Clone Database Search
Tobacco EST clones from BY-2 cells Database Search
Physcomitrella patens Full-Length cDNA Clone Database Search
RAFL cDNAs
Porphyra yezoensis (susabinori) EST dataset
RIKEN Arabidopsis Full-Length Clone Database Search
RIKEN-CIAT Cassava Full-Length Clone Database Search
KOMUGI
Full-Cryptosporidium
Full-Babesia
Full-Echinococcosis
Full-Tsetse
Full-Toxoplasma
ESTs of Lentinus edodes (shiitake mushroom)
Database of genomes and transcriptional regulations for filamentous fungi
マイクロアレイ
SBM Database(Systems Biology and Medicine Database)
Mouse DNA Microarray
COXPRESdb
RnR(Regulatory-network Research in Arabidopsis T87 cultured cells)
AtGenExpress
Transcriptome analysis of 2 component system in Eschericia coli
MacroArray Analysis Page of Bradyrhizobium japonicum
CIBEX(Center for Information Biology gene Expression database)
KEGG EXPRESSION
SAGE, CAGE, ATAC-PCR, iAFLP等
H-ANGEL(The Human Anatomical Gene Expression Library)
薬剤の制ガン作用と関連する遺伝子発現変化・公開データベース
BodyMap-Xs: anatomical and taxonomical breakdown of animal EST
BGED: Brain Gene Expression Database
CAGE
タンパク質
配列・ファミリー・タンパク質総合
dbCFC
Hepatitis Virus Database (Analysis results of hepatitis virus gene, lineage)
Deinococci Genome Database
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AAindex(Amino acid indices, substitution matrices and pair-wise contact potentials)
SEVENS database
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PREIMS
Advanced Technologies Atlas
CaMPDB
GPIアンカー型タンパク質候補遺伝子データベース
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ドメイン・モチーフ・立体構造
PepBase
RESOPS
VIPERdb
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Yorodumi 万見
PDBSTR
PDBWiki
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PoSSuM
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GENIUS Ⅱ
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ThYme
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EMDataResource
PCDDB: Protein Circular Dichroism Data Base
DNAproDB
AlphaFold DB: AlphaFold Protein Structure Database
機能・局在
TMIG-2DPAGE Proteome Database
KOP
Mouse Basement Membrane Bodymap
LfDB(Lectin Frontier Database)
GlycoPOD(GlycoScience Protocol Online Database)
CREATE portal(Collaboration of Regional Entities for the Advancement of Technological Excellence)
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RPG(Ribosomal Protein Gene Database)
PMD(Protein Mutant Database)
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HATODAS2
Autophagy Database
3DPL
発現
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MassBank
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HGPD(Human Gene and Protein Database)
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Genomic Object Net Pathway Database
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ProNuc(Protein-Nucleic Acid Complex Database)
AlloMAPS: Allosteric Mutation Analysis and Polymorphism of Signaling database
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COXPRESdb
GLIDA(GPCR-Ligand Database)
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CancerProView
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phosprof
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ReSpect
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PCIDB
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食品害虫サイト (貯穀害虫・天敵図鑑)
侵入生物データベース (Invasive Species of Japan)
Japanese Ant Image Database
Visual database of Primatology (サル学画像データベース)
農業生物資源ジーンバンク:動物画像データベース
VARIOUS MARINE INVERTEBRATES
MCPA2
ナショナルバイオリソースプロジェクト ニワトリ-ウズラ
海棲哺乳類図鑑
魚類写真資料データベース
南半球の魚図鑑
東シナ海・黄海のさかな
NPOTDB
貝類データベース
e-フォラム・ストック
日本産カミキリムシ画像データベース
FiMSeA
水生生物情報データーベース
日本の有藻性イシサンゴ類
J-amir: Japanese aquatic macroinvertebrate reference
病害虫被害画像データベース
農業生物資源ジーンバンク:動物遺伝資源の検索
牧野標本館所蔵タイプ標本データベース
写真で見る家畜の有毒植物と中毒
飼料作物病害図鑑
写真で見る外来雑草
薬用植物データベース
農業生物資源ジーンバンク:植物画像データベース
metabolomics.jp
資源作物見本園
やさい・くだもの百科
Tohoku Univ. Brassica Seed Bank (Brassica 近縁種保存系統)
アサガオ類画像データベース (MORNING GLORIES DATABASE)
ハイパー植物図鑑
富山大学薬学部附属薬用植物園 薬用植物データベース
薬用植物園&北方系生態観察園
府大キャンパス デジタル樹木図鑑
樹木実生図鑑
昭和薬科大学 薬用植物園 四季の植物紹介
農業生物資源ジーンバンク:植物遺伝資源の検索
農業生物資源ジーンバンク:在来品種データベース
原生生物情報サーバ
ウイルス図鑑
Digital Atlas of Actinomycetes
EPFDB (Entomopathogenic Fungi Database)
毒きのこデータベース
真菌・放射菌ギャラリー
有孔虫研究会Database
担子菌類遺伝子資源データベース
浮遊性有孔虫データベース
農業生物資源ジーンバンク:微生物画像データベース
Biological Information System for Marine Life
APASD(Asian-Pacific Alien Species Database)
博物図譜データベース
広島大学デジタル自然史博物館(公開維持系統データベース)
分類
KEGG BRITE
KEGG ORTHOLOGY
ELKUType
植物和名ー学名インデックス YList
AIIC(立川哲三郎博士寄贈寄生蜂類タイプ標本データベース TachikawaType)
AIIC(中條道夫博士寄贈甲虫類タイプ標本データベース(M.ChujoType))
AIIC(九州大学昆虫学教室所蔵ハナバチ類標本データベース(BeeELKU))
AIIC(福田弘巳博士寄贈ハナバチ類標本データベース(BeeFukuda))
AIIC(中央アジア産ハナバチ類標本データベース(BeeCAsia))
AIIC(外国産ハナバチ類多田内標本データベース(BeeFTadauchi))
AIIC(九州大学昆虫学教室所蔵寄生蜂類標本データベース(ProctELKU))
AIIC(佐々治寛之博士寄贈甲虫類標本データベース(COLSasaji))
AIIC(大塚勳氏寄贈熊本県産甲虫類標本データベース(COLOtsuka))
AIIC(愛媛大学所蔵甲虫類標本データベース(COLEUMJ))
水産食品の寄生虫検索データベース (D-PAF)
広島大学デジタル自然史博物館(コケ標本データベース)
ユスリカ標本DNAデータベース
山階鳥類研究所標本データベース
Type Collection Database
Virus-Host DB
日本産絶滅危惧植物のグローバルレッドリスト
微生物の迅速同定
瀬戸内海海藻類標本データベース
鹿児島大学博物館 維管束植物DB
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